Kehidupan Koushi Nagumo yang berusia dua belas tahun tiba-tiba menurun ketika ayahnya meninggalkannya setelah rumah mereka terbakar. Dibiarkan mengurus dirinya sendiri, Koushi pingsan di jalan, tetapi seorang wanita eksentrik bernama Mineru Wachi mengasihani dia dan membawanya ke asrama wanita “Megami-ryou”.

Setelah mengetahui situasi Koushi, Mineru, yang kebetulan adalah manajer sementara, mengundangnya untuk menjadi ibu asrama resmi Megami-ryou. Namun, apa yang menunggunya adalah penghuni asrama — masing-masing dengan kejahatan mereka sendiri — seperti Atena Saotome yang androfobia namun lembut, tomboi feminin Kiriya Senshou, dan Mineru sendiri, yang kecerobohannya tidak mengenal batas dalam hal sains. Meskipun demikian, Koushi melakukan yang terbaik untuk memenuhi tugas dari kehidupan baru yang gila ini!